阴茎异常勃起约有三分之一查不到原因，称之为原发性（或特发性）阴茎异常勃起，而其它能找到病因者称为继发性阴茎异常勃起。后者可能与下列因素有关。

血液病在阴茎异常勃起发病中占有重要地位，其中镰刀状细胞贫血是常见的原因。其发生可能是当红细胞变成镰刀状后容易在海绵体的血管窦状隙内聚集淤滞所致。但是不必担心，这种病在我国较少见。其它能引起此病的血液病包括地中海贫血，红细胞增多症、原发性血小板增多、多发性骨髓瘤等。

神经系统疾病

如脑出血、脑干病变、脊髓痨、癫痫病等均可能对脑、脊髓的勃起中枢长期病理性刺激而引起阴茎异常勃起。

局部刺激或疾病

易理解，像包茎、包皮手术、尿道炎、前列腺炎、尿路结石、肉镜检查等可以刺激神经末梢，通过脊髓神经反射性勃起环路促发阴茎异常勃起。。

炎症和变态反应

如流行性腮腺炎、睾丸炎、破伤风抗毒素等可引起血管周围淋巴细胞反应阻碍静脉回流。

其它一些疾病

如淀粉样变、慢性肾衰等有报告可引起阴茎异常勃起。